A Secretaria Regional do Mar, Ciência e Tecnologia tem a responsabilidade de gerir um dos principais fatores de desenvolvimento dos Açores – o Mar – incluindo no seu leque de competências as pescas e a aquicultura, a exploração oceanográfica, o licenciamento de usos do mar e dos seus fundos, as orlas costeiras e a cooperação com a Polícia Marítima.
A esta secretaria cabe também coordenar as políticas de Ciência e Tecnologia na Região, e o relacionamento com a Universidade dos Açores e demais entidades representantes da Sociedade de Informação.